FH Bielefeld
University of
Applied Sciences
Prof. Dr.-Ing.

Jan Rexilius

Lehrgebiet Angewandte Informatik, insb. maschinelles Sehen und Simulation
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jan.rexilius@fh-bielefeld.de
Lehrveranstaltungen
Aufgabenbeschreibung

Lehrgebiet
Angewandte Informatik, insb. maschinelles Sehen und Simulation

Publikationen

Patentanmeldungen (offengelegte Prioritätsschriften)

J. Rexilius, G. Blott (2020). Überwachungsvorrichtung, Überwachungsanlage, Verfahren, Computerprogramm und maschinenlesbares Speichermedium. DE102019203324A1, WO2020182503A1.
J. Rexilius, G. Blott (2020). Anonymisierungseinrichtung, Überwachungseinrichtung, Überwachungsvorrichtung, Verfahren, Computerprogramm und Speichermedium. DE102019205221A1, WO2020207738A1.
J. Rexilius, G. Blott (2020). Verfahren zum Erhalten einer Infrarotdarstellung einer Bildsituation und Recheneinheit, System und Computerprogramm zu dessen Durchführung. DE102019209282A1.
J. Rexilius, G. Blott (2019). Verfahren zum Einstellen einer Kamera. DE102017211038A1, CN109215073A, US2019005681A1, US10783664B2.
J. Rexilius (2018). Verfahren zum Betreiben eines Fahrzeuges. DE102017200572A1.
J. Rexilius, R. Borchers (2018). System zur Bewertung einer Situation und Verfahren zur Bewertung einer Situation. DE102017207939A1.
J. Rexilius, S. Nordbruch (2017). Verfahren zum Erkennen von Objekten auf einer Abstellfläche. DE102015216908A1, CN106504561A, FR3040818B1, US10007268B2.
J. Rexilius, G. Blott, S. Nordbruch (2017). Steuern eines Kraftfahrzeugs. DE102015222934A1, CN107031618A, FR3043972A1, US10059332B2.
J. Rexilius, J.K. Warzelhan, G. Blott, S. Nordbruch (2017). Fahrerunabhängige Überführung eines Kraftfahrzeugs. DE102015212689A1, FR3038568A1, US2017011631A1.
J. Rexilius, J.K. Warzelhan, G. Blott (2017). Verfahren und Vorrichtung zur Prüfung der Funktionalität einer außenseitigen Lichteinrichtung eines Fahrzeugs. DE102015223500A1.
J. Rexilius, J.K. Warzelhan, G. Blott (2017). Verfahren und System zum Absichern eines Durchfahrtsbereichs. DE102015222914A1.
J. Rexilius, M. Hoeynck, P. Guse (2014). Vorrichtung und Verfahren zum Ermitteln einer Raumtemperatur. DE102013208687A1.
J. Rexilius, S. Heigl, H. Fillbrandt, F. Mattern, D. Gottschlag, J.K. Warzelhan (2014). Überwachungssystem mit positionsabhängigem Schutzbereich, Verfahren zur Überwachung eines Überwachungsbereichs sowie Computerprogramm. DE102012212613A1, EP2875498A1, US9547905B2, WO14012753A1.
J. Rexilius, S. Heigl, H. Fillbrandt, F. Mattern, D. Gottschlag, J.K. Warzelhan (2014). Überwachungsanlage für einen Überwachungsbereich, Verfahren sowie Computerprogramm. DE102012222661A1, US10223886 B2, WO14090819A3.
J. Rexilius, S. Heigl, J. Ebling, D. Gottschlag (2014). Anzeigevorrichtung für ein Video¬überwachungs-system sowie Videoüberwachungssystem mit der Anzeigevorrichtung. DE102012211298A1, EP2868098A1, WO14001009A1.
J. Rexilius, S. Heigl, H. Fillbrandt, F. Mattern, D. Gottschlag, J.K. Warzelhan (2013). Auswertevorrichtung für ein Überwachungssystem sowie Überwachungssystem mit der Auswertevorrichtung. DE102012201591A1, WO13113521A1.
J. Rexilius, S. Heigl (2013). Analysevorrichtung zur Auswertung einer Überwachungsszene, Verfahren zur Analyse der Überwachungsszenen sowie Computerprogramm. DE102012200504A1.
J. Rexilius, J.K. Warzelhan (2013). Verfahren zum Ausblenden von einem oder mehreren Objekten von einer durch ein Videosystem erzeugten Bildsequenz. DE102011089033A1.
J. Rexilius, J.K. Warzelhan, M. Koenig (2011). Verfahren und Vorrichtung zur Lokalisierung von Personen in einem vorgegebenen Bereich. DE102010003669A1, US8983129B2, WO11124483 A1.


Zeitschriften und Konferenzbeiträge

J. Rexilius and K. Tönnies (2014). Automatic design of realistic Multiple Sclerosis lesion phantoms. In Workshop Bildverarbeitung für die Medizin, pp. 270–275, Springer.
D.M. Renz, H.K. Hahn. P. Schmidt, J. Rexilius, M. Lentschig, A. Pfeil, D. Sauner, C. Fitzek, H.J. Mentzel, W.A. Kaiser, J.R. Reichenbach, J. Böttcher (2010). Accuracy and reproducibility of a novel semi-automatic segmentation technique for MR volumetry of the pituitary gland. Neuroradiology. 53(4):233-44
C. Lukas, B. Bellenberg, H.K. Hahn, J. Rexilius, R. Drescher, K. Hellwig, O. Köster, and S. Schimrigk (2009), Benefit of repetitive intrathecal triamcinolone acetonide therapy in predominantly spinal multiple sclerosis: prediction by upper spinal cord atrophy, Ther Adv Neurol Disord: 2(6): 42–49.
F. Weiler, J. Rexilius, J. Klein, and H.K. Hahn (2009). NeuroQLab - A Software Assistant for Neurosurgical Planning and Quantitative Image Analysis. In Proc. GI Jahrestagung: 1352-1358.
D. Simon, J. Klein, J. Rexilius, T. Re, A. Lemke, F. Laun, and B. Stieltjes (2009). A Software Tool to automatically evaluate and quantify Diffusion Weighted Images. In Proc. World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, pp. 1194-1197,
D. Simon, J. Klein, J. Rexilius, and B. Stieltjes (2009). Objective Tumor Heterogeneity Determination in Gliomas. In Proc. SPIE Medical Imaging, pp. 72601X-1 – 72601X-9.
J. Rexilius and H.-O. Peitgen (2008). Evaluation of Accuracy in Partial Volume Analysis of Small Objects. In Proc. SPIE Medical Imaging, 6914: 69144X-1–69144X-10.
J. Rexilius and H.-O. Peitgen (2008). Rapid Prototyping of Clinical Software Assistants. In Proc. SPIE Medical Imaging, 6919: 69190S-1–69190S-11.
J. Rexilius, O. Konrad, and H.-O. Peitgen (2008). A Software Assistant for the Design of Realistic Software Phantoms. In Proc. SPIE Medical Imaging, 6914: 69144Y-1– 69144Y-10.
J. Klein, H. Stuke, J. Rexilius, B. Stieltjes, H.K. Hahn, and H.-O. Peitgen (2008). Towards User-Independent DTI Quantification. In Proc. SPIE Medical Imaging, 6914: 69142E-1–69142E-8.
Dirk Simon, Jan Klein, Jan Rexilius, Bram Stieltjes (2008). Towards User-Independent ADC Quantification in Gliomas. ESMRMB.
J. Rexilius, H.K. Hahn, J. Klein, M. Lentschig, and H.-O. Peitgen (2007). Multispectral Brain Tumor Segmentation based on Histogram Model Adaptation. Proc. SPIE Medical Imaging, 6514, 65140V-1-65140V-10.
S. Schimrigk, B. Bellenberg, M. Schlüter, B. Stieltjes, R. Drescher, J. Rexilius, C. Lukas, H.K. Hahn, H. Przuntek, and O. Köster (2007). DTI based quantification of fiber integrity in the corticospinal tract of ALS patients and controls using a new probabilistic mixture model. American Journal of Neuroradiology, 28(4):724-30.
J. Klein, A. Vilanova, P. Ledochowitsch, P. Bittihn, H.K. Hahn, O. Konrad, J. Rexilius, and H.-O. Peitgen (2007). Improving Interaction and Perception of Brain Structure using Fiber Clustering. SPIE Newsroom, DOI: 10.1117/2.1200707.0771, pp. 1-3.
J. Klein, M. Schlüter, J. Rexilius, O. Konrad, P. Erhard, B. Stieltjes, M. Althaus, W. Dreher, D. Leibfritz, H.K. Hahn, and H.-O.Peitgen (2007). Uncertainty and Repro-ducibility of Quantitative DTI and Fiber Tracking of the Human Brain. Topics in Advanced Imaging, 6: 61-64. BIS-Verlag, Oldenburg.
J. Klein, P. Bittihn, P. Ledochowitsch, H.K. Hahn, O. Konrad, J. Rexilius, and H.-O. Peitgen (2007). Grid-Based Spectral Fiber Clustering. SPIE Medical Imaging, 65091: 65091E-1–65091E-10.
J. Rexilius, J. Kuhnigk, H.K. Hahn, and H.-O. Peitgen (2006). An Application Framework for Rapid Prototyping of Clinically Applicable Software Assistants. GI Jahrestagung, LNI 93, 522-528.
B. Stieltjes, M. Schlüter, B. Didinger, W.-A. Weber, H.K. Hahn, P. Parzer, J. Rexilius, O. Konrad, H.-O. Peitgen, and M. Essig (2006). Diffusion Tensor Imaging in Primary Brain Tumors: Reproducible Quantitative Analysis of Corpus Callosum Infiltration as Measure of Contralateral Involvement. Neuroimage, 31:531-542.
H.K. Hahn, J. Klein, C. Nimsky, J. Rexilius, and H.-O. Peitgen (2006). Uncertainty in Diffusion Tensor Based Fibre Tracking. Acta Neurochirurgica, Suppl. 98, 33-41.
J. Klein, F. Ritter, H.K. Hahn, J. Rexilius, and H.-O. Peitgen (2006). Brain Structure Visualization using Spectral Fiber Clustering. Proc. SIGGRAPH.
M. König, W. Spindler, J. Rexilius, J. Jomier, F. Link, and H.-O. Peitgen (2006). Embedding VTK and ITK into a visual programming and rapid prototyping platform. Proc. SPIE Medical Imaging, 2006, 6141, 614120-1-614120-11.
A. Köhn, H.K. Hahn, J. Klein, J. Breitenborn, U. Siems, T. Böhler, W. Berghorn, E. Simonotto, F. Link, J. Rexilius, R. Lund, H. Jürgens, and H.-O. Peitgen (2006). A Workflow Optimized Software Platform for Multimodal Neurosurgical Planning and Monitoring. In Proc. CURAC, pp. 44-46.
J. Klein, H.K. Hahn, J. Rexilius, P. Erhard, M. Althaus, D. Leibfritz, and H.-O. Peitgen (2006). Efficient Visualization of Fiber Tracking Uncertainty based on Complex Gaussian Noise. In Proc. ISMRM, 2753.
J. Rexilius, W. Spindler, J. Jomier, M. König, H.K. Hahn, F. Link, and H.-O. Peitgen (2005). A framework for Algorithm Evaluation and Clinical Application Prototyping using ITK. Insight Journal as part of the ISC/NAMIC/MICCAI Workshop on Open-Source Software, 1–8.
J. Rexilius, J. Jomier, W. Spindler, F. Link, M. König, and H.-O. Peitgen (2005). Combining a Visual Programming and Rapid Prototyping Platform with ITK. In Workshop Bildverarbeitung für die Medizin, pp. 460–464. Springer.
J. Rexilius, H.K. Hahn, M. Schlüter, H. Bourquain, and H.-O. Peitgen (2005). Evaluation of Accuracy in MS Lesion Volumetry using Realistic Lesion Phantoms. Academic Radiology 12, 17–24.
M. Schlüter, B. Stieltjes, H.K. Hahn, J. Rexilius, O. Konrad, H.-O. Peitgen (2005). Detection of Tumor Infiltration in White Matter Fiber Bundles Using Diffusion Tensor Imaging. Int J Medical Robotics and Computer Assisted Surgery, 1(3): 80-86.
J.F. Verhey, J. Wisser, S.K. Warfield, J. Rexilius, and R. Kikinis (2005). Non-rigid registration of a 3D ultrasound and a MR image data set of the female pelvic floor using a biomechanical model. BioMedical Engineering OnLine, 4:19.
M. Schlüter, O. Konrad-Verse, H.K. Hahn, B. Stieltjes, J. Rexilius, and H.-O. Peitgen (2005). White Matter Lesion Phantom for Diffusion Tensor Data and Its Application to the Assessment of Fiber Tracking. Proc. SPIE Medical Imaging, 5746, pp. 835-844.
S. Behrens, T. Boskamp, L. Bornemann, H. Bourqain, V. Dicken, J. Drexl, H.K. Hahn, A. Hennemuth, M. Hindennach, S. Kohle, S. Krass, B. Kümmerlen, S. Kuhagen, J, Kuhnigk, M. Lang, F. Link, G. Prause, T. Preusser, R. Rascher-Friesenhausen, J. Rexilius, A. Schenk, M. Schlüter, A. Weihusen, S. Zidowitz, and H.-O. Peitgen (2005). Computer aided image based diagnosis and therapy planning. European Radiology, vol. 15, 571
J. Rexilius, H.K. Hahn, M. Schlüter, S. Kohle, H. Bourquain, J. Boettcher, and H.-O. Peitgen (2004). A Framework for the Generation of Realistic Brain Tumor Phantoms and Applications. In C. Barillot, D. Haynor, and P. Hellier (Eds.), Proc. MICCAI, LCNS 3217, pp. 243–250. Springer.
J. Rexilius, H.K. Hahn, M. Schlüter, B. Bellenberg, C. Lukas, and H.-O. Peitgen (2004). A Flexible Research and Development Platform for Diagnosis and Therapy Monitoring in Multiple Sclerosis. In Proc. ESNR.
C. Lukas, H.K. Hahn, B. Bellenberg, J. Rexilius, G. Schmid, S.K. Schimrigk, H. Przuntek, O. Koster, and H.-O. Peitgen (2004). Sensitivity and reproducibility of a new fast 3D segmentation technique for clinical MR-based brain volumetry in multiple sclerosis. Neuroradiology 46(11): 906-915.
H.K. Hahn, B. Jolly, M. Lee, D. Krastel, J. Rexilius, J. Drexl, M. Schlüter, B. Terwey, H.-O. Peitgen (2004). How Accurate is Brain Volumetry? A Methodological Evaluation. Proc. MICCAI, LNCS 3216: 335-342, Springer.
H.K. Hahn, J. Rexilius, M. Schlüter, B. Terwey, B. Stieltjes, F. Giesel, and H.-O. Peitgen (2004). Fast and Robust Quantification of Parahippocampal Atrophy via Temporal Horn Index. Workshop Bildverarbeitung für die Medizin, pp. 371-375, Springer.
M. Schlüter, B. Stieltjes, J. Rexilius, H.K. Hahn, and H.-O. Peitgen (2004). Unique Planar Color Coding of Fiber Bundles and Its Application to Fiber Integrity Quantification. Proc. ISBI—International Symposium on Biomedical Imaging, pp. 900-903.
M. Schlüter, B. Stieltjes, H.K. Hahn, J. Rexilius, O.K. Ferse, and H.-O. Peitgen (2004). Early Stage Detection of Tumor Infiltration in White Matter Fiber Bundles Using Diffusion Tensor Imaging. In Proc CURAC.
J. Rexilius, H.K. Hahn, H. Bourquain, and H.-O. Peitgen (2003). Ground Truth in MS Lesion Volumetry—A Phantom Study. In Proc. MICCAI, LNCS 2879, pp. 546–553. Springer.
H.K. Hahn, J. Rexilius, M. Schlüter, B. Stieltjes, P. Raab, F. Giesel, and H.-O. Peitgen (2003). Flexible Research and Development Platform for Multimodal Neurosurgical Planning and Therapy Monitoring. In Proc CURAC.
J. Rexilius, H.K. Hahn, S.K. Schimrigk, C. Lukas, H. Bourquain, and H.O. Peitgen (2003). Uncertainty in MS Lesion Volumetry. In Proc. ECTRIMS.
J. Rexilius, H. Handels, A. Navabi, R. Kikinis, and S.K. Warfield (2002). Automatic Nonrigid Registration for Tracking Brain Shift during Neurosurgery. In Workshop Bildverarbeitung für die Medizin, pp. 135–138. Springer.
S.K. Warfield, A. Guimond, A. Roche, A. Bharatha, A. Tei, F. Talos, J. Rexilius, J. Ruiz-Alzola, C.-F. Westin, S. Haker, S. Angenent, A. Tannenbaum, F. Jolesz, and R. Kikinis (2002). Advanced Nonrigid Registration Algorithms for Image Fusion. In Brain Mapping. The Methods, Chapter 24, pp. 661-690, Academic Press.
J. Verhey, A. Ludwig, J. Rexilius, S.K. Warfield, C. Mamisch, R. Kikinis, C.-F. Westin, R. Seibel, and O. Rienhoff (2002). Multimodale nicht-rigide Registrierung von Ultraschall- und MR Bilddaten unter Verwendung eines biomechanischen Modells. Workshop Bildverarbeitung für die Medizin, pp. 310-313, Springer.
J. Verhey, A. Ludwig, J. Rexilius, S.K. Warfield, C. Mamisch, R. Kikinis, C.-F. Westin, and O. Rienhoff (2002). Verwendung eines biomechanischen Modells, um im Kopf-Hals-Bereich Ultraschall und MR Bilddaten nicht-rigide zu registrieren. Ultraschall 2002, pp. 6-8.
J. Rexilius, S.K. Warfield, C.R.G. Guttmann, X. Wei, R. Benson, L. Wolfson, M. Shenton, H. Handels, and R. Kikinis (2001). A Novel Nonrigid Registration Algorithm and Applications. In Proc. MICCAI, LCNS 2208, pp. 923–931, Springer.
S.K. Warfield, J. Rexilius, P.S. Huppi, T.E. Inder, E.G. Miller, W.M. Wells, G.P. Zientara, F.A. Jolesz, and R. Kikinis (2001). A Binary Entropy Measure to Assess Nonrigid Registration Algorithms. Proc. MICCAI, LNCS 2208, pp. 266-274, Springer.


Promotion, Diplomarbeit

J. Rexilius (2015). Software Phantoms in Medical Image Analysis. Promotion, Universität Magdeburg.
J. Rexilius (2001). Physics-Based Nonrigid Registration for Medical Image Analysis. Diplomarbeit, Medizinische Universität zu Lübeck.

Curriculum Vitae

Beruflicher Werdegang

seit 2021
Professor für Angewandte Informatik, insb. maschinelles Sehen und Simulation an der FH Bielefeld

2013-2021
Projektleiter, Robert Bosch GmbH, Corporate Research, Hildesheim

2008-2021
Entwicklungsingenieur, Robert Bosch GmbH, Corporate Research, Hildesheim

2001-2008
Wissenschaftlicher Mitarbeiter, MeVis Research, Bremen (heute: Fraunhofer MeVis)

Studium und Promotion

2015
Dr.-Ing., Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg

2001
Diplom-Informatiker, Medizinische Universität zu Lübeck

2000-2001
Diplomarbeit & Forschungsaufenthalt am Surgical Planning Laboratory, Harvard Medical School, Boston

Forschungsgebiete

Forschungsinteressen

Bildverarbeitung, Computer Vision
Erzeugung von synthetischen Daten